es mas facil de lo que crees..

1. Escoges la capa que le vas hacer degradado transparente.

2. haces click en el boton añadir mascara.

3. seleccionando la capa donde tienes la mascara añadida escoges relleno.. ya una vez ahi le puedes dar el aspecto que necesitas, en tu caso como necesitas degradado transparente, pues de un lado escoges negro y del otro no escoges nada lo dejas transparente obviamente.  no escogas blanco pues no te crea el transpareten.

sera que me hice entender.. ??