El título de tu post, con la explicación que das, y la frase final me confunden. Entonces, lo quieres hacer en javascript o en Java? Si es en Java que API estás usando para crear la UI, Swing? AWT? SWT?
Si es javascript y es para la web entonces te das cuenta que este no es el lugar correcto para hacer la pregunta y que javascript y Java no tienen nada que ver.
Vale me equivoque

es javascript, solo que no encontre el area.

Podrias buscar Jquery . Hay muchos tutoriales para hacer lo que quieres, busca sobre ventanas flotantes jquery
Vale tio, muchas gracias, lo buscare asi
