Veo que tienes sumo interes en cambiar el codigo de Moodle para que no trabaje con el APi de MySQL y si con el API de SQLite.

Pero... como te dije No es una tarea sencilla, requerira mucho tiempo de tu parte hacer esto, no es solamente cambiar la variable de conexión a la DB... es tambien cambiar TODAS las funciones de todos los headers (archivos include o require) que posea el Moodle, donde haga consultas, eliminacion, actualizacion, etc... en MySQL ya que deberas sustituir todas esas funciones + sus parametros y esto no es una accion de 20 minutos que conste.

Necesitaras conocer y saber manejar el lenguaje PHP para que puedas saber donde sustituir cuales cosas, nosotros no podemos ayudarte en esa indole. Es un trabajo largo y tedioso, y deberas leer y aprenderte las funciones del SQLite este link te la describe todas:

http://www.hackingballz.com/herramientas/manual-oficial-de-php/book.sqlite.html

Ahi podras sustituir todas las funciones de MySQL por las que el link anterior te refiera de SQLite... pero te aseguro que es mucho mas rapido y facil si gestionaras que te dispongan un servidor compatible a Moodle, o utilizar otra herramienta similar a Moodle pero que soporte SQLite nativamente.