Por lo que veo el .STACK no tiene ningun efecto en el ejecutable final.
En la cabecera opcional del PE hay dos campos sobre la pila:
SizeOfStackReserve Size of stack to reserve. Only the Stack Commit Size is committed; the rest is made available one page at a time, until reserve size is reached.
SizeOfStackCommit Size of stack to commit.
http://download.microsoft.com/download/e/b/a/eba1050f-a31d-436b-9281-92cdfeae4b45/pecoff.docEl enlazador (link.exe) se encarga de escribirlos, 0x100000 (1MB) y 0x1000 (4KB=una pagina) son sus valores por defecto. Con la opcion /
STACK podes cambiarlos.