Hola,
No me quedo claro si lo que quieres es infectar un archivo en un PC o en un móvil.
Bueno, te diré que la mayoría de las infecciones que se realizan en Android es por Bugs que encuentran y los explotan, o bién bugs en el SO o bién en las aplicaciones.
Yo sinceramente la única manera que veo viable de infectar dispositivos con android es con esta, ya que todas las aplicaciones se descargan desde el APP Store.
Por otra parte si quieres infectar archivos en Windows puedes leer esto:
http://foro.elhacker.net/analisis_y_diseno_de_malware/formato_pe-t446963.0.htmlQue te servirá para infectar ejecutables.
Para "infectar" o simular la infección de un .rar, .mp3, .doc, etc puedes usar un binder o joiner.
saludos.