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Pero por otra parte antes de instalar debian, tuve ubuntu, y con ubuntu si que me funcionaba el arranque de windows, teniendo el activador que tengo ahora. 
Aunque no tenia la misma versión de grub.
Aunque no tenia la misma versión de grub.
Entonces prueba a usar la versión antigua del GRUB en vez del GRUB2 de Debian.
Tienes el paquete deb del GRUB 0.97 en los repositorios de Debian bajo el nombre grub, eso si, antes deberías desinstalar el GRUB2 que ya tienes instalado en Debian.
Pero recuerda que las consultas de Linux van en el foro de Linux y las de Windows en el foro de Windows... así que no mezclemos los temas.
En línea
Mira a mi paso lo mismo, nunca nu habia pasado (falta bootmgr) ynente formatiarlo barias veces y instale vista,win7,xp y instalaba y igual me canse prove con un disco viejo que tenia lo formatie e instale 
