Buenas!

Si descargaras cualquier tipo de herramienta que se considere para hacking por asi decirlo es mejor desactivar el antivirus porque lo detectaran como maliciosa. Ahora bien para utilizarlo no precisamente debe ser desde una maquina virtual puedes ejecurtarlo desde tu windows normal ya estando seguro que lo que descargas es de fiar.

Ahora si quieres evitar a todo costa alguna infeccion ahi si lo mejor seria una maquina virtual.