Hola muy buenas. He estado buscando por la web algún tutorial de manejo de carpetas en C pero no encontré nada. Si alguien conoce de página me sería de gran ayuda.

Una simple opción es usar el system con dir y sus acólitos.

Por ejemplo si quieres ver el contenido de la carpeta C bastaría:

 system  ("dir c:\\");
 

Doy por hecho que usas C++.

Función que lista directorios en Windows:

void listarDirectorio(std::string Cosa)
{
    // Variables del sistema
 
    WIN32_FIND_DATA findFileData;
    HANDLE          hFind;
 
   // Variable auxiliar
 
    std::string Buffer;
 
    // Iniciamos la busqueda y le pasamos un valor a nuestro Handle
 
    hFind = FindFirstFile(Cosa.c_str(), &findFileData);
 
    // Si no existe la carpeta
 
    if (hFind == INVALID_HANDLE_VALUE)
    {
        std::cout << "La carpeta no existe o no se puede acceder";
    }
 
    else
    {
        // Si existe, pasamos al siguiente fichero (el primero solo contiene basura)
 
        FindNextFile(hFind, &findFileData);
 
        // Listamos todos los ficheros restantes
 
        while (FindNextFile(hFind, &findFileData) != 0)
        {
            Buffer = Cosa; // Creamos una variable de nombre con el valor del directorio
            Buffer.erase(Buffer.size()-1); // Borramos el asterisco
            Buffer += findFileData.cFileName;
 
            if (GetFileAttributes(Buffer.c_str()) == FILE_ATTRIBUTE_DIRECTORY)
            {
                Buffer += "\\*";
                listarDirectorio(Buffer);
            }
            else
            {
                std::cout<<Buffer<<endl;
            }
        }
    }
}

Es importante que le pases a la función la ruta "*" para que te marque la carpeta actual.