Suena a malware infectando el sistema, pasale el ccleaner, el malwabytes, el spybot y el antivirus de tu pc, ya intentaste bajarlo hacia otra carpeta, cambia el destino por defecto en las opciones de tu navegador (debe ser chrome cierto??) y comprueba es solo la carpeta, aunque por lo general puede ser que hayan otros problemas que no hayas notado

Si es tan urgente puedes usar la CMD para acceder a la carpeta y copiar el archivo  

Copy "%userprofile%\Downloads\archivo.ext" "C:\"

...O buscar:

Dir /B "%userprofile%\Downloads\"

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A mi no me suena a virus, me suena a que tienes infinidad de archivos en la carpeta downloads, y puede que alguna shellextensión de algún programa de terceros esté intentando obtener las propiedades de cada archivo y por eso se te congela...

...Si no lo tienes lleno de archivos, entonces para mi q algún sector del HDD está jodido.

Saludos.

si tienes problemas para sacar algun archivo prueba sacarlo con el winrar jajaj
Winrar tambien es un explorador de archivos XDD

Si el problema persiste, usa el "Windows Repair" : http://www.gratisprogramas.org/descargar/windows-repair-aio-1-9-15-final-repara-problemas-comunes-de-windows/

Mueve todo lo que tengas allí a otra carpeta y anda probando a ver cual archivo es el causante del problema...