Inicia la consola de Windows (cmd.exe) para utilizar el comando Format:
Sintaxis:
Format "Volumen" /V:"Nueva etiqueta del volumen" /X /Q
Ejemplo:
Format "C:" /V:"Disco Formateado" /X /Q
Necesitarás reiniciar el PC para proseguir el formateo, ya que no se puede formatear el volumen activo, entonces el proceso de formateo se inicia al bootear el sistema operativo.
EDITO: Si lo que pretendes es reinstalar Windows, entonces lee lo que dijo Hurdano.
Saludos