yo probaria a pasarle el ccleaner.. por si fuese que dejo algo en el registro y consta como que aun lo tienes instalado... sino.. nose.. pero si no quieres verlos dale directamente a ocultar y san se acabo

Puedes hacer algo parecido, No guardar nunca más ningún icono de programas en esa lista (Solo se verán los de microsoft)

@echo off
Taskkill /F /IM explorer.exe
Reg delete "HKEY_CURRENT_USER\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\TrayNotify" /v "IconStreams" /F
Reg delete "HKEY_CURRENT_USER\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\TrayNotify" /v "PastIconsStream" /F
start /B explorer
exit
 

PD: cuidado al usarlo, jeje

Saludos

Gracias, Aunque eso es mucho trabajo xD

Para Windows 8 si que haré version de 32 y 64 bit, Y creo que lo haré más "bonito", en VB6 o GTK+

Saludos!