¿El nombre de dichos directorios acaso no se almacena en disco?
Que se almacene no significa que Windows tenga porque mostrarte esa información.
El nombre que le das a una carpeta, o a un archivo, hace referencia en otro lugar.
Por lo demás, No se la respuesta/razón a tu duda, Pero no creo que te puedan ayudar a resolverla al 100%, sinceramente, Así que te daré mi hipótesis razonable con buena intención, Aunque no te sirva como una respuesta esclarecedora:
Windows mide el espacio basandose solo en el contenido del archivo/carpeta. ¿Porque? Porque es lo más coherente, Si tuvieras un archivo vacío, Con un nombre de 8 dígitos, El nombre pesaría 8 bytes, Y si Windows te dijera que el archivo pesa 8 bytes, Entonces no podrías deducir si el archivo está vacío por dentro, ¿Verdad?. Simplemente lo han hecho así poque es una medida razonable para no confundir al personal, ¿A quien le importa lo que pese un archivo por su nombre? Cuando se trabaja con un archivo lo que uno quiere saber es cuanta información hay ocupada en el contenido del archivo, Y lo mismo con las carpetas, Si metieras 100 directorios vacíos dentro de una carpeta, Si windows te dijera lo que pesan solo por el nombre... pues tendrías que mirarte las 100 carpetas manualmente para saber si realmente existen archivos dentro o no, para poder eliminar las carpetas, Pues como ves, No sería un proceso fluido para nadie.
Saludos