La de Falete...la tuya hijo, la tuya...
Para que no tengas que pensar ni buscar ni na...Ejecuta todo esto:
$ sudo -i
# chmod +x /media/VBOXADDITIONS_3.1.0_55467/VBoxWindowsAdditions-AQUITUARQUITECTURA.run
# cd /media/VBOXADDITIONS_3.1.0_55467/
# ./VBoxWindowsAdditions-AQUITUARQUITECTURA.run
No se trata de resolverle la vida a todos, mejor hazlo que comprenda o tendrás que ir envolviéndole la vida a todo el mundo.
La razón por la que no te instala las "Guest Additions" es porque no estas seleccionando correctamente la arquitectura de tu distribución o porque estas intentando instalar el ejecutable de Windows, en Linux la cosa es algo diferente, la solución que te propuso Tzhed es muy buena, aunque hay otra opción:
1.- Buscas la carpeta donde se encuentra la versión de la arquitectura de tu distro(Ubuntu) (32 o 64)
2.- Bueno si presionas Ctrl + L, veras la barra de dirección de Nautilus te deja escribir o seleccionar la ruta completa a tu ubicación actual, copia esa ruta.
3.- Abres una terminal y escribes cd seguido de Shift + Ins (lo que hace esto es pegar el texto copiado en la terminal) con el comando cd nos ubicamos en la ruta donde están los archivos, ahora escribe sudo -s (esto te permite usar el usuario root en la ruta actual), te va a pedir tu contraseña de administrador y aunque parezca que no escribe ponla y dale enter.
4.- Por último escribes sh autorun.sh (con esto lo que haces es decirle a la terminal que interprete el script autorun.sh)
5.- Reinicias y configuras desde preferencias de pantalla.
Verifica que la versión de VirtualBox sea la más reciente porque la versión 11.04 de Ubuntu no va bien con versiones viejas de VirtualBox.