Tengo una duda, en que parte del codigo agrego el link a mi servidor para que descargue el archivo de configuracion?
Exacto, el cource no lo necesitas, compila los 2 programas "tal cual", con el maker generas el fichero de configuración que subirás al server y al lado del updater dejarás el smart.cfg que contiene la URL para descargar el fichero generado por el maker.