solo me tiene que comparar la ultima jugada de la matriz, a eso lo de jugada[t+9]

Con esto:

char ganadoras[11][3]={"333","444","555","666","222","111","336","446","556","331","332"};

Declaras un array de 11 elementos y cada uno es un array de 3 elementos de tipo char. El punto importante es: como cada elemento no tiene capacidad para el '\0' este se descarta, son secuencias de caracteres (no son cadenas) y por ello no puedes utilizar funciones para el manejo de cadenas que requieran del '\0' como strcmp.

Como realizar la comparación depende del tipo de la variable "jugada". Si el tipo es el mismo puedes utilizar "strncmp" o "memcmp" para comparar los primeros tres elementos (caracteres).

Para evitar adivinanzas mejor coloca la declaración de las variables que intentas comparar.

Un saludo