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Gracias por sus respuestas. el archivo original lo puse en un struct, no se si tal vez estoy ingresando allí algo mal.
Mi código para el struct:

Código:

struct IRIS{
	double sl;
	double sw;
	double pl;
	double pw;
	string clase;

	void llenarDatos(string linea){
		stringstream ss;
		ss << linea;
		string token="";
		for(int i=0;i<COLS;i++){
			getline(ss,token,',');
			stringstream aux;
			aux << token;
			switch(i){
				case 0:
					aux >> sl;
				break;
				case 1:
					aux >> sw;
				break;
				case 2:
					aux >> pl;
					break;
				case 3:
					aux >> pw;
					break;
				case 4:
					clase=token;
				break;
			}
		}
	}

	string toString(){
		stringstream ss;
		ss << sl << "," << sw <<","<< pl << "," << pw << "," << clase;
		return ss.str();
	}
};

Mi codigo para leer el archivo:

Código:

vector<IRIS> archivo::cargarDatos(string ruta){
	IRIS muestra;
	string linea="";
	ifstream fichero;
	vector<IRIS> datos;
	fichero.open(ruta.c_str(),ios::in);
	if(fichero.is_open()){
		cout<<"ok"<<endl;
                while((getline(fichero,linea,'\n'))!=NULL){
		  muestra.llenarDatos(linea);
		 datos.push_back(muestra);
	        }
	}else{
		cout<<"error al abrir el fichero"<<endl;
	}
	

	return datos;
}

vector<string> archivo::cDatos(string ruta){
vector<string> datos;
fstream fichero;
fichero.open(ruta.c_str(),ifstream::in);
string linea="";
while(getline(fichero,linea,'\n')!=NULL){
cout<<"linea: "<<linea<<endl;
datos.push_back(linea);
}
fichero.close();
return datos;
}