Sep, pero si viene aqui es que no le queda otra alternativa 
Bueno, si lo prefieres, te digo que Windows le traera mas problemas que este. Los de Ubuntu son "diferentes". 

Si prefiere pasar un AV... OK, pero ya no me fio de ellos desde que me borraron mi sys32.exe porque le di sin querer a mandar a analizar a la web de Kasp.  Pobrecillo,  buscare una copia

Buen punto, seguire meditando sobre como afrontar este tema de los key.

p_num = int(raw_input('Ingrese el primer numero'))
s_num = int(raw_input('Ingrese el segundo numero'))

from math import *
if sqrt(s_num) == p_num:
    print 'El segundo es exactamente el cuadrado del primero'
elif sqrt(s_num) < p_num:
    print 'El segundo es menor que el cuadrado del primero'
else:
    print 'El segundo es mayor que el cuadrado del primero'

Mmmmm, lo mejor es formatting y Live CD. (Sep, hoy me he levantado con ganas de decirlo y de triturar algun SO Windows xD...)