Solucionado. Básicamente después de mucho leer en forum.hddguru.com y usar varias herramientas para trabajar con discos duros, y ninguna con resultado efectivo, las que me han servido para este menester han sido 3: MHDD (la versión que tiene terminal), el programa Victoria y principalmente y el que ha echo todo el trabajo ha sido la herramienta  Zú
Aqui podemos ver la solución, incluido videos: http://yura.projektas.lt/files/wd/royl_mhdd.html