Así sin mirar mucho y con esto de aprender un poco de python hice este script , según mis pruebas funciona, aunque seguro que se puede hacer mil veces mejor. Saludos.
for i in lines: print(i) resul_UAN_202 = i.find('UAN_202') resul_UIU_111 = i.find('UIU_111') if ((resul_UAN_202 > 0) or (resul_UIU_111 >0)): print("borrar") else: file_w.write(i) print(lines)