De la base de datos en principio no tengo ningun problema en usar una u otra, con MySQL tengo más experiencia que con MSSQL y el transact, pero en principio, es un proyecto a medio-largo plazo, no sería un problema estudiar uno u otro en mayor medida, aunque la verdad, todos se parecen mucho, al menos en consultas basicas.
Si ya que las 2 responden al estandar ANSI SQL, obviamente que ademas cada motor al margen del estandar tienen sus propias implementaciones y mejoras, pero en este caso yo me inclinaria mas por MySQL ya que es multiplataforma en cambio con MSSQL necesitas de un Windows Server
.
El problema está en que el otro chaval que está junto conmigo en el tema del código es mac user, él no podria hacer uso de WinForms, obviamente, no?
WinForms no, pero GTK# si... Pero viendo que ya en tu equipo se maneja mucho Java, yo te sugeriria que sigas en ese camino, aprender otro lenguaje seria liarte un poco...
Salu10.