te recomiendo usar el minipe es un lice cd, hay una herramienta que se llama regiter wizard algo asi, proba volver a un dia o varios de los que te muestra en ese programa, tambien hay una opcion del chkdsk, que son 5 pàsos, nose en cuantos lo hiciste ese que dijiste vos chkdsk /r

con el dvd de win 7 podes hacerlo

como dicen arriba podes cambiar de particion mis documentos etc, tambien podes redimencionar particiones con el partition magic etc

quizas tengas las actualizaciones en automaticas, podes reparar aunque no creo que te solucione eso sino mira http://www.foromagios.net/post/16339/pantalla-negra-de-windows-7.html