Se tendria que descifrar a mano sin ayuda de programas no?

Yo te diria probar un LIVE CD que sea antivirus, Avira creo que ofrece ese servicio para estos casos. Saludo

Que buena onda la informacion

Faltaron los 3 terminos de la seguridad informatica mas importantes

Confidencialidad: Es la propiedad de prevenir la divulgación de información a personas o sistemas no autorizados. A groso modo, la confidencialidad es el acceso a la información únicamente por personas que cuenten con la debida autorización.

Integridad: Es la propiedad que busca mantener los datos libres de modificaciones no autorizadas. A groso modo, la integridad es el mantener con exactitud la información tal cual fue generada, sin ser manipulada o alterada por personas o procesos no autorizados.

Disponibilidad: La disponibilidad es la característica, cualidad o condición de la información de encontrarse a disposición de quienes deben acceder a ella, ya sean personas, procesos o aplicaciones. Groso modo, la disponibilidad es el acceso a la información y a los sistemas por personas autorizadas en el momento que así lo requieran.

Te diria que le eches un vistazo al subforo de seguridad que se trata de Criptografia, ahi hay manuales, informacion, casos reales, noticias, todo en fin (? saludos http://foro.elhacker.net/criptografia-b56.0/

Bueno amigo, sinceramente soy nuevo en esto pero te diria que hagas esto:
Los virus como sabras son programas que tienen la funcion de ejecutarse, instalarse y autoejecutarse, osea, siempre que encendes la computadora automaticamente se ejecutan y cumplen ciertos objetivos para lo que estan programados. Segun mi experiencia y lo que te podria decir, es probable que tengas un tercer virus que controle que esos dos esten, y cuando no lo estan los vuelve a instalar, muy probablemente un rootkit, busca formas de detectar y eliminar rootkits, yo creeria que es eso. Saludos Megahom