hola a todos , les cuento mi idea , ahora mismo en la universidad estamos dando en autómatas , como crear un copilador usamos Jlex , mi pregunta era si se podia realizar un cambio en el copilador general de los programas para que use por la fuerza en que creemos nosotros

y también quería saber si se puede cambiar los datos de la tabla de registro/traduccion de las ip (la que al poner www.ej.com sabe la direccion ip , no me acuerdo ahora mismo del nombre ) y que tipo de permisos se necesitan para poder editar esa tabla

Que estas hablando? Acaso lo haz comprobado por ti mismo para decir algo como eso? Procmon no es bloqueado por antivirus, el ejecutable y el driver estan firmados por Microsoft. De lo contrario indicá qué Antivirus esta bloqueando o detectando eso de dices que hacen.

Yo no probé aun, pero lo voy a intentar.. resulta que tengo 2 versiones de avast instaladas,, una en la pc del trabajo y la otra en casa, en la versión del trabajo me salta la ventana de "enviar al baúl o permitir" al inyectar una dll en cualquier proceso, y en la de casa no. El lunes voy a empezar a hacer pruebas, a ver si es tan complicado..

Saludos!!

PD: Lo bueno de mi trabajo es que tengo 8 maquinas a mi disposición, y programo 8 hs por día.. 

Bueno, me gusto el reto.. lo voy a intentar de las dos formas si es necesario,, con Procmon parece ser mas sencillo, pero por si las dudas,, si creo las imagenes del disco, cual seria el mejor metodo para compararlas? Tiene pinta de llevar mucho tiempo/trabajo eso jeje igual, lo puedo intentar.. pero,, con las herramientas adecuadas, el trabajo es mas sencillo 

Procmon es mejor:
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb896645.aspx
Monitoreo en tiempo de ejecución.