Quizás no se pueda con la herramienta que utilizaste, porque no intentar con una de las herramientas que menciona la documentación. Si ya estas en Kali, puedes usar dd como lo menciona la documentación.

pues abre una terminal y pon:

leafpad /etc/apt/sources.list


y yo tengo estos repositorios,a lo mejor te valen para tu version prueba,si no puedes usarlos en la nueva.

# Regular repositories
deb http://http.kali.org/kali sana main non-free contrib
deb http://security.kali.org/kali security sana/updates main contrib non-free
deb http://http.kali.org/kali kali-rolling main contrib non-free


# Source repositories   
deb-src http://http.kali.org/kali sana main non-free contrib
deb-src http://security.kali.org/kali security sana/updates main contrib non-free
deb-src http://http.kali.org/kali kali-rolling main contrib non-free



yo tengo estos,si añades mas procura que sean oficiales.

pues yo la baje hace 4 dias la copie en un cd y todo perfecto,pero si esa version te deja actualizar todo y te funciona bien quedate con esa,añadiste los repoditorios e hiciste un apt-get update y un apt-get upgrade¿?

¿Como la has montado? ¿Seguiste la documentación de Kali?

http://docs.kali.org/downloading/kali-linux-live-usb-install

A menos que las cosas hayan cambiado cuando cambiaron a rolling release.

yo estoy usando la version de enero,estoy escribiendo desde ella,no bajes versiones antiguas porque se cambio al tipo rolling,puedes ver mis post que hace una semana instale la version 1.1.0 que tenia en un cd y no podia instalar nada porque cambiaron los repositorios,Debes de estar haciendo algo mal,estas usando graficall install o que haces,yo la verdad baje la ISO y la copie a un CD y sin problema,y acuerdate que tienes que hacer una particion del tamaño de tu memoria ram y ponerla de zona de intercambio,y la otra ext4 y ponerlo como \(raiz).
saludos.

Si tienes la imagen de enero de 2016, olvidate, el problema es de la imagen. Yo tengl el Kali 2.0 de 2015 y va perfect, y esta que sacaron en enero no funciona, entra en bucle. En cuanto a los pendrive y linux, yo nunca he tenido problema. Con Lili , todo es mas facil.

yo por lo que veo el tema del usb da mas problemas que otra cosa,i no quieres andar haciendo particiones,instalatelo en una VM como virtualbox o alguna otra,pero yo te recomendaria hacerte una particion del disco duro y tener los dos sistemas,pero si solo lo quieres para probar pues lo mas recomendable es una VM ,si no te funciona o algo la borras y listo,y mira que sea la ultima version,que no te pase como a mi que tenia una antigua en un cd y no podia actualizar nada.
un saludo.