Probá entrando al SETUP de la PC, y fijate que la secuencia de booteo esté en orden (o sea, para arrancar primero del floppy), o bien en algunos dispositivos de hardware se te permite mediante alguan tecla F (F12 por ejemplo) seleccionar por única vez, desde donde bootear. Fijate, seguro que es eso, o algo hiciste mal o tenes una mala copia del programa.

O sino tenes esta otra opción:

El que lo necesite mandeme un PM, que le paso un link o se lo mando yo al mail, con una ISO lista para quemarse en un CD del CIA COMMANDER. La unidad óptica me ha resultado más práctica de utilizar que el diskette, sin embargo de esta última manera  también se puede.