Ya conseguí descongelar windows después de restaurar la imagen del sistema conforme estaba.
Después de ello, procedí a instalar el nuevo windows y el problema es el mismo. Aparentemente no tendría nada que ver con lo de estar congelado...
Cabe decir que la típica partición de windows de 100mb que general al instalarlo, ni está en el sistema original ni la hace al instalar el segundo.
Creo que el asunto es configurar correctamente el arranque.
He llegado a realizar las reparaciones con todas las opciones comando bootrec sin ningún resultado (tanto desde la reparación de inicio del sistema problemático como con el disco de instalación de windows).
Concretamente, usando bootrec /rebuildbcd me arroja el mensaje siguiente: Total de instalaciones de Windows identificadas: 0.
Siguiendo las instrucciones de un tutorial para reparar un arranque con el problema que comentaba en el primer post (MissingOsLoader), he renombrado el archivo bcd de la carpeta boot y vuelto a ejecutar el comando. En ese momento encuentra las dos instalaciones de Windows e imagino que reconstruye el arranque incluyendo ambas en él.
Después de eso, el windows nuevo sigue arrancando bien, pero en el original da un error diferente:
File: \Windows\system32\winload.exe
Status: 0xc0000428
Info: Windows cannot verify the digital signature for this file.
Voy a intentar reparar este error concreto. Si no, volveré a restaurar la imagen del sistema descongelado que hice, para no tener que repetir todo el proceso cada vez, y veré si estaba congelada todas las particiones o solo C:
A ver si entre todos logramos solucionar ésto...