Estoy intentado recuperar la matriz y del archivo guardarla en la matriz pero solo me lo guarda los 100 elementos en la primera posición del arreglo y quiero que me guarde cada elemento en sus coordenadas.

#include <iostream>
#include <fstream> //Libreria de Archivos o Ficheros
using namespace std;
 
int menu(){
 
	int x;
	cout<<"-----Bienvenido-----"<<endl<<endl;
	cout<<"1.-Agregar Personas"<<endl;
	cout<<"2.-Ver Personas"<<endl;
	cout<<"3. Buscar Personas"<<endl;
	cout<<"4.-Salir"<<endl;
	cout<<"Elige una opcion:"<<endl;
	cin>>x;
 
	return x;
}
	int x=0,y=0;
 
void agregar(ofstream & Esc){
 
	system("cls");
 
 
	                  //Crea archivo | agrega elementos al archivo existente
	Esc.open("Personas.txt",ios::out);//Crea archivo
 
 
	cout<<"elige las columnas de tu arreglo"<<endl;
	cin>>x;
	cout<<"elige los renglones de tu arreglo"<<endl;
	cin>>y;
 
	string arr[x][y];
	string a;
 
 
	cout<<"elige el caracter de tu arreglo"<<endl;
	cin>>a;
 
		for(int i=0;i<x;i++){
			for(int j=0;j<y;j++){
 
				arr[i][j]=a;
			}
	}
 
		for(int i=0;i<x;i++){
 
			for(int j=0;j<y;j++){
 
				Esc<<arr[i][j];
			}
				//Esc<<"\n";
	}
 
 
	Esc.close();//Cerra el Archivo
 
}
 
void Ver(ifstream & Lec){
 
	system("cls");
 
	string arr[x][y];
	int i,j;
 
	Lec.open("Personas.txt",ios::in);//Abre el archivo y extrae los datos
	cout<<"Personas Registrada"<<endl<<endl;
 
		while(!Lec.eof())//busca hasta el final del archivo  End of File()
       { 	
      		while(!Lec.eof())//busca hasta el final del archivo  End of File()
      		 { 
				Lec>>arr[i][j];
			j++;	
			}
			i++;
		}
 
	//	cout<<arr[0][0]<<endl;
	//	cout<<arr[0][1]<<endl;
	//	cout<<arr[0][2]<<endl;
		for(int i=0;i<x;i++){
 
			for(int j=0;j<y;j++){
 
				cout<<arr[i][j];
 
			}
				cout<<endl;
		}
//	}
	Lec.close();
	system("pause");
}
 
 
 
void Buscar(ifstream & Lec){
 
	system("cls");
	// variables para guardar los datos del archivo
	string nom;
	string ape;
	string mat;
	//------------------
	string auxmat; //Guarda el valor de el dato que quiero que busque
 
	Lec.open("Personas.txt",ios::in);//Abre el archivo y extrae los datos	
 
	bool encontrado=false;
 
	cout<<"Digite la matricula: "<<endl;
	cin>>auxmat;
 
	Lec>>nom;
 
	while(!Lec.eof() && !encontrado)
	{
 
		Lec>>ape;
		Lec>>mat;
 
		if(mat==auxmat)
		{
 
			cout<<"Nombre--------:"<<nom<<endl;
			cout<<"Apellido------:"<<ape<<endl;
			cout<<"Matricula-----:"<<mat<<endl;
			cout<<"_______________"<<endl;
 
			encontrado=true;	
		}
	}
	Lec.close();
 
	if(!encontrado)
		cout<<"Dato no encontrado"<<endl;
 
 
	system("pause");
 
}
 
int main(){
 
	ofstream Esc; //Se usa para archivo de salida	
	ifstream Lec; //Se usa para archivo de entrada
 
	int op;
 
	do{
 
	    system("cls");
		op=menu();
 
		switch(op)
		{
 
			case 1: 
			   agregar(Esc);
			   break;
 
			case 2:
				Ver(Lec);
				break;
 
			case 3:
				Buscar(Lec);
				break;
 
 
		}
 
	}while(op!=4);
 
}

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MOD: El código debe estar entre etiquetas de Código GeSHi