El funcionamiento basico de un sistema como el que planteas es el siguiente:

FASE de nrolamiento
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dedo -> [SCANNER] -> imagen -> [EXTRACCION DE RASGOS] -> plantilla biometrica -> [ALMACENAR EN BD]              (OJO aqui: normalmente se almacena si no esta, por lo que se hace tambien verificacion)

FASE de Verificacion
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dedo -> [SCANNER] -> imagen -> [EXTRACCION DE RASGOS] -> plantilla biometrica -> [COTEJO(para cada plantilla en la base de datos)] -> esta, no esta

El SDK debe proporcionarte:
-El algorimo de extraccion de rasgos, generalmente alguno basado en minucias
-El algoritmo de cotejo [MATCHER] que determina si dos plantillas pertenecen al mismo dedo o no

En principio pudieras usar el propio SDK que trae el scaner.

El driver debe proporcionarte la posibilidad de acceder a la imagen (independientemente del SDK), aunque el SDK debe traer alguna funcionalidad especifica para esto. Esto ultimo es por si deseas emplear algun otro SDK disponible, o emplear algoritmos propios para la extracción de rasgos y el cotejo.

Como base de datos puedes usar tanto SQL como no SQL (p.e Tokyo Cabinet). Por tu parte queda implementar al algoritmo de indexacion-recuperacion que sea lo mas eficiente posible. Por ejemplo pudieras usar algun ID unico e implementar la busqueda sobre alguna extructura tipo diccionario (para esto tal vez sea mejor una BD no sQL, dan mas libertad). Aunque esto solo es critico solo cuando el numero de usuarios (es decir, el tamanho de la BD es muy grande)

salu2 y espero haber sido de ayuda