No es un bug, el error que cometes es que para efectuar el unshadow debes copiar estos dos archivos en la ubicación de John the ripper, en BT5 seria :

#cd /pentest/passwords/john

una ves has copiado los dos archivos en esta ruta y ademas te ubicas en la misma, puedes utilizar sin problema el comando unshadow.

/pentest/passwords/john# ./unshadow   /pentest/passwords/john/passwd   /pentest/passwords/john/shadow  >  archivo.txt

y listo, ahora puedes atacar con JOHN

/pentest/passwords/john# ./john archivo.txt

Espero sea de utilidad

Nota : si quieres actualizar Jhon the ripper   :  #apt-get install john