Me gustaria ver tu implementacion. Yo he hecho lo mismo
pero utilizando la api de windows, createPipe, duplicateHandle, etc, pues para leer la stdOut del Process necesitas cerrar el StdIn con lo cual si escribes cmd> cd..
el siguiente comando q ejecutes no estaras en el directorio en el q lo dejaste. Utilizando la api no ocurre lo mismo, con lo cual se puede mantener la StdIn abierta a la vez q se lee el StdOut.
Saludos