Salu2...
Cierto acotando un poquito mas respecto a herramientas Java (J2SE= Java 2 Standard Edition)

Ciertamente para empezar a usar java tendremos que instalar la maquina virtual de java  mas conocido como el JRE y el SDK o JDK que son las herrmientas para crear aplicaciones java

Herramientas para usar java en Windows

Instalar  Descagar Eclipse SDK 3.2
http://www.eclipse.org/downloads/download.php?file=/eclipse/downloads/drops/R-3.2.2-200702121330/eclipse-SDK-3.2.2-win32.zip&url=http://mirror.switch.ch/eclipse/eclipse/downloads/drops/R-3.2.2-200702121330/eclipse-SDK-3.2.2-win32.zip&mirror_id=63

Descargar paquete para traducir el Eclipse SDk3.2
http://www.eclipse.org/downloads/download.php?file=/eclipse/downloads/drops/L-3.2.1_Language_Packs-200609210945/NLpack1-eclipse-SDK-3.2.1-win32.zip&url=ftp://ftp.cise.ufl.edu/pub/mirrors/eclipse/eclipse/downloads/drops/L-3.2.1_Language_Packs-200609210945/NLpack1-eclipse-SDK-3.2.1-win32.zip&mirror_id=66

Descargar Neatbeens en Castellano

http://www.netbeans.info/downloads/start.php?f_id=15142&lang_id=11

Jcreator es otra buna opcion aunque, personalmente me eh acostumbrado a trabajar con Eclipse


Herramientas para trabajar en linux

Igual que en windows, usamos java Sun


Observacion:

El proyecto Blackdown, tambien conocido como java-Linux, tiene el objetivo de una implementacion de codigo abierto de las distinatas versiones de JDK, encontrandose en continuo desarrollo a medida que SUN va anunciando actualizaciones de la plataforma java. Gente si quieren visitar la pagina principal del proyecto aqui les dejo la paina oficial

http://www.blackdown.org/

Lo que obtendremos en los distintos paquetes son herraimentas de desarrollo accesibles desde la linea de somandos, identicas a las de JDK original de Sun, por lo que usariamos, basicamente, el mismo metodo de trabajo que utilizariamos con el producto Sun. La diferencia, como ya eh dicho es que estariamos empleando una implementacion de CODIGO ABIERTO.

Kaffe: Como eh dicho anteriormente , el JDK de java puede obtenerse directamente de la web de Sun e instalarse en un sistema GNU/Linux sin ningun cargo (costo), a pesar de no tratarse de software libre. por tanto, la cracion de aplicaiones en java no tendria por que suponer mayor problema. Un caso distinto es la ejecucion, puesto que no basta con distribuir los archivos  de clases, que contiene el bye-code Java, al no poderse ejecutar directamente. Es precisa una maquina virtual de java, sea la oficial de Sun o cualquier otra.

Kaffe es una implememntacion de una maquina virtual de java, incluyendo el conjunto de bibliotecas de clases que conforman el JRE, pero disponible con una licencia de codigo abierto. Es, por lo tanto, una opcion a tener en cuenta si necesitamos distribuir aplicaiones Java junto con una maquina virtual
la pagina oficial  de esat maquina se las dejo aqui

http://www.kaffe.org/

El incoveniente de kaffe, y de otras solucones de codigo abierto, es que siempre va por detras de las ultimas especificaiones de la plataforma  JAva, lo que significa que no esatan disponibles todos los servicios que podemos encontrar en la implementacion oficial. Esto no significa, que no pueda ser utilizada como amquina virtual para aplicaiones que no precisan esos servicios avanzados o de aparicion posterior a la liberacion de kaffe
Creo que me explaye demasiado  ; sin embargo un poco de concetos siempre es bueno tenerlos en cuenta.

Salu2...