simple.... incio con el cd de windows como si fueses a instalarlo, y en la primera pantalla de opciones seleccion, la opcion r ( reparar) , despues que cargue la consola, utiliza los siguientes ocmandos...
fixboot c: ( siendo c la unidad donde esta windows si esd, entonces seria d: )

y despues


chkdsk /r /p

espera a que termines y, ya!!