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He estado buscando y no logro encontrar la forma de obtener la ruta de la aplicación de la ventana activa, alguien tiene alguna idea de como sería

Hola!

El primer ejemplo que armé sacado de consultas de Google (notepad debe estar corriendo):

using System;
using System.Diagnostics;
using System.Runtime.InteropServices;
 
namespace test {
    internal class Program {
 
        [DllImport("user32.dll", CharSet = CharSet.Auto, SetLastError = true)]
        private static extern int GetWindowThreadProcessId(IntPtr handle, out uint processId);
 
        public static string GetProcessPath(IntPtr hwnd) {
            uint pid = 0;
            GetWindowThreadProcessId(hwnd, out pid);
            Process proc = Process.GetProcessById((int)pid);
            return proc.MainModule.FileName.ToString();
        }
 
        static void Main(string[] args) {
            Process[] processes = Process.GetProcessesByName("notepad");
 
            foreach (Process p in processes) {
                IntPtr windowHandle = p.MainWindowHandle;
                Console.WriteLine(GetProcessPath(windowHandle));
            }
            Console.ReadKey();
        }
    }
}
 

Algo a tener en cuenta es lo bits de tu ejecutable con los bits del ejecutable que quieres localizar. Si creas el tuyo como x86 y el target es x64, no funcionará. Deberás crear el tuyo como x64 para poder acceder a los de procesos de 64 bits.

Saludos!

Creo que con el pedazo de código que tengo me puedo explicar mejor

Imports System.Runtime.InteropServices
 
Public Class Form1
 
    Private WithEvents tmr As New Timer With {.Interval = 100, .Enabled = True}
 
    <DllImport("user32.dll")>
    Private Shared Function GetForegroundWindow() As IntPtr
    End Function
 
    Private Sub Form1_Load(sender As Object, e As EventArgs) Handles MyBase.Load
 
    End Sub
 
    Private Sub tmr_Tick(sender As Object, e As EventArgs) Handles tmr.Tick
        Dim hWnd As IntPtr = GetForegroundWindow()
        Text = hWnd
 
        'Aquí necesito obtener la ruta de la aplicación que tiene la ventana activa
        'usando el hWnd que me devuelve la API GetForegroundWindow
        'o de alguna otra manera
        'Lo importante es que se obtenga la ruta de la aplicación que tiene la ventana activa
 
    End Sub
 
End Class
 

Hola!

En mi ejemplo, deberías usar la funcion GetProcessPath (fijate que recibe un hWnd y devuelve un string con el path).

Saludos!