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Ya puedo sacar el promedio de cada fila, pero de cada columna ? linea [75 a 85], tenia años sin hacer esto  :-X ,,,en la linea 38 llamo al metodo getPromedioFila y le paso un array, intente hacer algo parecido con la linea 51 de varias maneras pero me da java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException

 
import java.text.DecimalFormat;
 
/*
 * @Array 2D como promediar cada columna ? 
 */
public class Array2Dimensiones implements Mostrar {
 
	private int array[][];
	private int array2[][];
	private DecimalFormat dosDigi = new DecimalFormat("0.00");
 
	public Array2Dimensiones( String descripcion, int array[][], int array2[][] ) {
		print("\""+descripcion+"\"\n");
		this.array = array;
		this.array2 = array2;
		mostrarArray();
	}
 
	public void mostrarArray() {
		print("Array 2D completo\n");
		for( int tmp[] : array) {
			for( int tmp2 : tmp ) {
				print("{"+tmp2+"}");
			}
			print("\n");
		}
 
		/*
		 * PROMEDIO DE CADA FILA 
		 */
		print("Promedio de cada fila \n");
		for( int f=0; f<array.length; f++ ) {
 
			for( int c=0; c<array.length; c++ ) { 
				print(""+array[f][c]);
			}
			double promedio = getPromedioFila( array[f] );
			print("\t\t\t\t"+dosDigi.format(promedio)+"\n");
		}
 
		/*
		 * PROMEDIO DE CADA COLUMNA
		 */
		print("Promedio de cada columna \n");
		for( int f=0; f<array.length; f++ ) {
			double promedio = 0;
 
			for( int c=0; c<array[f].length; c++ ) { 
				print(""+array[c][f]);
				promedio = getPromedioColumna(array[c]);
			}
 
			print("\t\t\t\t"+dosDigi.format(promedio)+"\n");
		}
	}
 
	/*
	 * PROMEDIO FILA
	 */
	public double getPromedioFila( int array[] ) {
 
		int suma = 0;
		for( int f=0; f<array.length; f++ ) {
			suma += array[f];	
		}
		return (double) suma / array.length;
 
	}
 
	/*
	 * PROMEDIO COLUMNA
	 */
	public double getPromedioColumna( int array[] ) {
 
		int suma = 0;
		for( int f=0; f<array.length; f++ ) {
			for( int c=0; c<array[f]; c++ ) {
				suma += array[c];
			}
		}
		return (double) suma / array.length;
 
	}
 
	@Override
	public void print( String s ) { System.out.print(s); }
	public static void main( String []blablabl) {
 
		int array[][] = {{1,2,3},
		                {4,5,6},
	                        {7,8,9}};
 
		int array2[][] = {{1,2,3},
			         {4},
				 {5,6,7}};
 
		new Array2Dimensiones("2 tipos de Array 2d e Irregular",array,array2);
 
	}
}
 

"2 tipos de Array 2d e Irregular"
Array 2D completo
{1}{2}{3}
{4}{5}{6}
{7}{8}{9}
Promedio de cada fila 
123				2,00
456				5,00
789				8,00
Promedio de cada columna
Exception in thread "main" java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 3
	at Array2Dimensiones.getPromedioColumna(Array2Dimensiones.java:80)
	at Array2Dimensiones.mostrarArray(Array2Dimensiones.java:52)
	at Array2Dimensiones.<init>(Array2Dimensiones.java:18)
	at Array2Dimensiones.main(Array2Dimensiones.java:99)
 
 

Te dejo lo que creo es la solucion si no entendi mal lo que quieres hacer, lo he ajustado para que sirva en array "regular" e "irregular".

import java.text.DecimalFormat;
 
/*
 * @Array 2D como promediar cada columna ? 
 */
public class Array2Dimensiones implements Mostrar {
 
	private int array[][];
	private int array2[][];
	private DecimalFormat dosDigi = new DecimalFormat("0.00");
 
	public Array2Dimensiones( String descripcion, int array[][], int array2[][] ) {
		print("\""+descripcion+"\"\n");
		this.array = array;
		this.array2 = array2;
		mostrarArray();
	}
 
	public void mostrarArray() {
		print("Array 2D completo\n");
		for( int tmp[] : array) {
			for( int tmp2 : tmp ) {
				print("{"+tmp2+"}");
			}
			print("\n");
		}
 
		/*
		 * PROMEDIO DE CADA FILA 
		 */
		print("Promedio de cada fila \n");
		for( int f=0; f<array.length; f++ ) {
		    double promedio = 0;
		    int c;
			for( c=0; c<array[f].length; c++ ) { 
				print(""+array[f][c]);
				promedio += array[f][c]; 
			}
			print("\t\t\t\t"+dosDigi.format(promedio / c)+"\n");
		}
 
		/*
		 * PROMEDIO DE CADA COLUMNA
		 */
 
		//obtenemos la longitud mas alta de las columnas para repetir el bucle for
		int cantidad = 0;
		int temp = 0;
		int x, y;
        int[] segundo;
        for (x = 0; x < array.length; ++x) {
          segundo = array[x];
          for (y = 0; y < segundo.length; ++y) {
              temp++;
          }
          if(cantidad <= temp)
          {
              cantidad = temp;
              temp = 0;
          }
        }
 
		print("Promedio de cada columna \n");
 
		for( int f=0; f<cantidad; f++ ) {
			double promedio = 0;
			int count = 0;
			int c;
			for( c=0; c < array.length; c++ ) {
			    //se filtran las posiciones del array con valor nulo
			    if(array[c].length > f)
			    {
			    	print(""+array[c][f]);
			    	promedio += array[c][f];
			    	count++;
			    }
			}
			print("\t\t\t\t"+dosDigi.format(promedio / count)+"\n");
		}
 
	}
 
 
	@Override
	public void print( String s ) { System.out.print(s); }
	public static void main( String []blablabl) {
 
		int array[][] = {{1,2,3},
		                {4,5,6},
	                        {7,8,9}};
 
		int array2[][] = {{1,2,3},
			         {4},
				 {5,6,7}};
 
		new Array2Dimensiones("2 tipos de Array 2d e Irregular",array,array2);
 
	}
}