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He realizado un programa que al introducir un numero de caracter en un vector te dice el numero de 1 y 0.

#include <stdio.h>
/*#include <math.h>*/
int main (int argc, char *argv[]) {
 
 
char bin[100];	
int n=0,n2=0,i;/*decimal0,decimal1,i;*/
printf("Escribe un numero binario:\n:");
scanf("%c",&bin);
/*Cantidad de 1 y 0*/
for(i=0;i<100;i++) {
	/*cantidad de 1 y 0*/
 
	if ((bin[i]=49) ||(bin[i]=48)) {
		n=n+1;
		printf("%d",n);
	}
	n2=n2+1;
}
	printf("N2 vale %d\n",n2);
	printf("N vale %d\n",n);
	return 0;
}
 

El problema es que cuando lo ejecuto,  la funcion "if" no funciona de la manera que espero (que a n se le sume uno cuando lea que hay un caracter con el valor 49  y 48 en ASCII que equivale al 1 y al 0) y y empieza a sumar un uno a n cada vez que se ejecuta el bucle.
(http://imageshack.com/a/img924/2554/q4yQov.png)
En este caso n tendria que valer 3

Gracias por vuestro tiempo

tienes 2 errores

primero
%c lee un caracter... si quieres leer una cadena de ellos usa %s o %99c (99 porque el ultimo debe ser \0)

segundo

cada vez que llegas al if, bin se torna 49... tienes que usar "==" para comprar no "="

Me ha funcionado. muchas gracias.