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se podria hacer lo mismo pero con el prototitpo EOF 

#include <cstdlib>
#include <iostream>
#include <string>
 
using namespace std;
int main(int argc, char *argv[])
{
    char cadena1[100],cadena2[100];
    int i=0,k=0,mapers=0;
 
    cout<<"ingrse primera cadena "<<endl;
    gets(cadena1); 
    cout<<"ingrse primera cadena "<<endl;
    gets(cadena2); 
 
   for(i=0;strlen(cadena1);i++)
   {
             if(strchr(cadena2,i<cadena1[0])!=NULL)
             {
              mapers++;
             }
    }
    cout<<mapers<<endl;
 
 
    system("pause");
 
}
 
 

Cambia gets por fgets
http://foro.elhacker.net/programacion_general/programacion_segura_buffer_overflows_by_strcpy-t95901.0.html (http://foro.elhacker.net/programacion_general/programacion_segura_buffer_overflows_by_strcpy-t95901.0.html)
Salu2