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Buenas gente, tengo el siguiente Código:

import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
 
import javax.swing.JDesktopPane;
import javax.swing.JFrame;
import javax.swing.JInternalFrame;
import javax.swing.JOptionPane;
import javax.swing.JPanel;
import net.sf.optexanalyzer.guitable.CompactTable;
import net.sf.optexanalyzer.table.Table;
import net.sf.optexanalyzer.table.Title;
 
import java.awt.event.MouseAdapter;
import java.awt.event.MouseEvent;
import java.lang.Object;
import javax.swing.ImageIcon; 
import javax.swing.JLabel; 
import javax.swing.event.TableModelEvent; 
import javax.swing.event.TableModelListener; 
import javax.swing.table.AbstractTableModel; 
 
public static void main(String[] args) {
 
 
       JPanel panel;
       Table table = new Table(4,3);
 
        table.initializePercentage();
 
 
        List<Title> columnTitles = new ArrayList<Title>();
        List<Title> rowTitles = new ArrayList<Title>();
 
 
        Title tituloFil1 = new Title();
        Title tituloFil2 = new Title();
        Title tituloFil3 = new Title();
        Title tituloFil4 = new Title();
        Title tituloCol1 = new Title();
        Title tituloCol2 = new Title();
        Title tituloCol3 = new Title();
        Title tituloCol4 = new Title();
 
        tituloFil1.setName("Algoritmo 1");
        tituloFil2.setName("Algoritmo 2");
        tituloFil3.setName("Algoritmo 3");
        tituloFil4.setName("Algoritmo 4");
        tituloCol1.setName("");
        tituloCol2.setName("Best");
        tituloCol3.setName("Score");
        tituloCol4.setName("#Bot");
 
 
        columnTitles.add(tituloCol1);
        columnTitles.add(tituloCol2);
        columnTitles.add(tituloCol3);
        columnTitles.add(tituloCol4);
        rowTitles.add(tituloFil1);
        rowTitles.add(tituloFil2);
        rowTitles.add(tituloFil3);
        rowTitles.add(tituloFil4);
 
        table.setColumTitles(columnTitles);
        table.setRowTitles(rowTitles);
 
        CompactTable compact = new CompactTable(table);
        JFrame frame = new JFrame();
 
        panel = compact.getCompactTable();
        panel.setVisible(true);
 
 
        frame.getContentPane().add(panel);
        frame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DISPOSE_ON_CLOSE);
        frame.pack();
        frame.setVisible(true);
        JFrame ventana = new JFrame();
        JDesktopPane desktop = new JDesktopPane();
        ventana.getContentPane().add(desktop);
        JInternalFrame internal = new JInternalFrame();
        desktop.add(internal);
 
  }

mi pregunta es:
quiero cambiar el titulo con esta instruccion:

       String entrada;
	        entrada=JOptionPane.showInputDialog(null, "Cambiar Titulo");
	        System.out.print(entrada);

pero, como pudeo hacer para que salte el evento al hacer doble click sobre la columna? Un saludo y gracias!

Primero agrega un MouseListener al header de la tabla

table.getTableHeader().addMouseListener

Luego en el metodo auto generado mouseClicked haces lo siguiente:

@Override
			public void mouseClicked(MouseEvent e) {
				if(e.getClickCount()==2){
				  String entrada;
				  int column = table.columnAtPoint(e.getPoint());
			         if ((column > -1)){
			        	 try{
			        	 entrada=JOptionPane.showInputDialog(null, "Cambiar Titulo");
			        	 table.getColumn(table.getColumnName(column)).setHeaderValue(entrada);
			        	 table.updateUI();
			        	 }catch (Exception ex) {
			        	 	}
			        	 }
			         }
			}

Y con eso ya cambiaría el titulo al hacer doble click.

Un Saludo.

Muchas gracias, me sirvio bastante. Un saludo