HOla
Lei tu problema y como te han ayudado a solucionarlo, y bueno, dices que el video se convierte, pero se pierde la secuencia del audio, intenta convertirlo usando el convertidor SUPER 2007, es muy bueno y admite un gran numero de formatos distintos, lo puedes usar como convertidor y como reproductor de archivos, trata de hacerlo con este, lo puedes bajar de softonic, o buscalo en google, solo escribes "SUPER 2007" y listo, es freeware y no requiere key ni nada por el estilo, tampoco caduca, es 100% seguro y muy confiable. Usalo para convertir el video y me dices si te funciono.
Saludos