Las imágenes usadas son del tutorial original:
http://foro.elhacker.net/index.php/topic,70942.0.html
1.- Abrimos un nuevo documento del tamaño que gusten. Por defecto tenemos una capa en blanco, pues crearemos otra capa nueva. Tendremos la capa "Superior" e "Inferior".
2.- A la capa superior le aplicamos un degradado de blanco a negro, así:

Y la ponemos en modo Diferencia. De la dirección de este degradado dependerá la dirección final del rayo.
2.- En la capa inferior aplicamos el filtro Filtros > Renderizado > Nubes > Ruido sólido. Nuestro documento debe verse así:

3.- Combinamos las capas con Imagen > Aplanar imagen. E invertimos los colores (Capa > Colores > Invertir).

4.- Ajustamos los niveles en Capa > Colores > Niveles y en Niveles de entrada donde por defecto pone 1.00, le ponemos un valor cercano a 0.10 (o a tu gusto).

5.- Y Finalmente ajustamos el color en Capa > Colores > Balance de color. En este caso le puse en Amarillo-Azul el valor de +50.

Resultado real de Gimp:

Los resultados pueden variar debido a que el filtro de nubes es aleatorio.