Hola,
Siguiendo lo que ha dicho @Songoku, he conectado la gráfica en el carril de... no sé cuántos carriles xd, de mi placa, y todo ha funcionado bien.
El que quiera entender que entienda:
Como ven el PCIe de la gráfica ha dejado un gran espacio en el carril, lo cual era mi duda de si iba a funcionar. Pero está funcionando sin problemas.
Gracias!