SAlio una actualziacion de jdownloader hazla a ver si corrige algo.
Lo he actualizado y sigue dandome los malwares de la captura que te puse.Una cosa que lo analizas desde sistema gŕafico haz desde una terminal en superusuari@ esto deberia bastar para que te los detecte :
clamscan -r --remove --heuristic-scan-precedence --detect-broken --algorithmic-detection --bell --recursive=yes /home/Jenag/.jd
Yo JDownloader lo tengo hay en esa ruta tú u otros pueden poner las suyas para proceder con la prueba.Mi JDownloader en :
/home/Jenag/.jd
Pruebalo y cuando sea me comentas si no te detecta nada o si.Saludos portaro.