Es que creo que está habiendo un malentendido en ese aspecto. Comparto lo que quieres decir, pero en mi BIOS aparece así.



Es decir, solo puedo asignar un tipo de booteo, no hay manera posible de que haya conflicto entre varios. Por lo tanto, como anteriormente decía, estoy usando el modo Legacy por que es el único con el que arranca tanto el LiveUSB como el SO del SSD.
Ni en modo "UEFI" ni en modo "UEFI with CSM" arraca, el cual, refiriéndome a este último, no es que seleccione UEFI por una parte y CSM por otra (sería contradictorio como bien dices ya que es diferente booteo) sino que la opción se llama así.

Por este motivo es por lo que solo uso Legacy, ya que es la única manera de que entre al USB o al SO con su respectivo congelamiento. Al menos hasta que averigüe por que en los otros dos modos me mete a la BIOS de cabeza, es como si el Secure Boot estuviera activado aún desactivándolo...

Voy a probar lo que dices, usando las tres opciones de booteo independientes, pero voy a instalar una nueva versión stable que han sacado de Manjaro hace una semana y no me había dado cuenta, con actualización de X.org y demás temas relacionados con drivers y entorno gráfico.

https://manjaro.org/2016/09/13/stable-update-2016-09-13-xorg-stack-firefox-plasma5-kde-apps-manjaro-tools-gcc/

He hecho lo que comentabas, he podido iniciar desde el modo UEFI al LiveUSB:



Posteriormente he instalado el SO:



Y vuelta al mismo error, con la única diferencia que en la selección del Grub se ve a una resolución más pequeña. Después de iniciar, pega el mini pantallazo y se bloquea en el mismo lugar.

PD. Intenté instalarlo mediante el CLI, pero no detectaba el SSD y tuve que agregarlo manualmente. Al final de los pasos tenia que añadir el bootloader en el SSD, pero no me aparecia tampoco y ahí no podía añadirlo.