Hola, creo que el problema lo tienes al principio de las cosas......
Si quieres instalar Windows y despues cualquier linux, lo primero es formatear el HDD y crear las particiones adecuadas.
Teniendo siempre en cuenta que primero se instala en una partición primaria, en NTSF, Window, luego crea las partciones Ext4 necesarias para los linux que quieras.
Pero nunca al reves, nunca al reves, nunca al reves.....
Saludos.