o en vez de comprarte una mother y meterte en un quilombo mas o menos, ponete a programar pic o picaxe y listo , es mas facil y mas barato, y ademas reprogramable...
Por ahi dependa de cuanto quieras gastar y lo flexible del sistema en si. Lo mas economico es un pic y listo, pero ahi no podrias cambiar los parametros en juego, como ser, horas de regado, hora a la que se prendan las luces, etc. Todo eso podrias simplificarlo con una mini pc, como la que comentas. lo que por ahi podrias hacer si estas ducho en electronica es realizar una placa grande con un pic estilo 16f877 o alguno mas moderno como el 18f que ya traen usb, y que maneje todo y cada vez que quieras cambiar algun parametro lo conectas a tu pc por usb o serial y te armas algun programita en visual u otro lenguaje comodo a tu gusto y de ahi modificas los parametros. Seria mas comodo que andar modificando el codigo de tu micro todas las semanas....digo, es una idea