Lo diré claramente. Sí.
Y cuantas más acciones hagas con el en la máquina, más.
Y si lo que intentas con el lápiz es ejecutar algo raro (para sacar privilegios, editar registro o similar), puede que hasta te queden cosas en el registro de sucesos del sistema.
Por poder, el dueño de la máquina también puede tenerte metido algún bicho en la máquina para copiarse todo tu pen nada más lo enchufas sin que te des cuenta.
A dudas generales, respuestas generales.