Bueno amigos, pues he conseguido todo lo que dice el titulo 
He tenido que crearme dos scripts (uno para poner la tarjeta en modo monitor y otro para ponerla en modo managed), instalar el airodump-ng en ubuntu, crear 3 lanzadores para ejecutar los scripts con permisos de root, crear un directorio con permisos de escritura y lectura para que lo use airoscript para meter todo lo que el va creando y tambien modificar el airoscript y funciona perfecto. He probado y ha destripado mi wifi en na, como si estubiera en backtrack o wifislax.

Intentare crear ahora el tutorial aunque me he llevado 2 dias para conseguirlo y ya ni me acuerdo de lo que fui haciendo.
Si a alguien le interesa que me lo diga y le paso el airoscript modificado y los 2 scripts.

Edito: me confundi, por favor ponganlo en la zona de hacking wireles de linux.
Gracias.

que chip tienes en la tarjeta wifi??? si es la ar5007eg te valdra todo sin problemas pero si no podria variar algo aunque podria ayudarte a buscar la solucion ya que practicamente el proceso sera el mismo y solo puede ser que te varie la direccion de la mac ya que a mi al poner con mac changer 00:11:22:33:44:55 al ponerla en modo monitor con airmon-ng me aparecia como 06:11:22:33:44:55 asi que como no pude encontrar solucion para que no me lo hiciera pues opte por modificar airoscript.sh y hacer que use esa como MAC_FAKE y tendrias que cambiar eso a lo mejor dependiendo del comportamiento que te diera a ti al poner tu mac fake. Es muy facil de hacer.
Te paso los scripts y un manual que me he montado cogiendo trozos de varios tutos. Quiero dejar claro que yo lo que hice fue coger trozos de manuales y que en realidad no es obra mia exactamente sino que lo que hice fue recopilar partes de otros muy buenos.

http://rapidshare.com/files/147854653/airoscript_en__Ubuntu_8.04.rar.html

con cualquier problema comentas y te intento ayudar.