No tenia oportunidad de contestar espero te pueda ayudar en algo

¿Ya verificaste que efectivamente en C:\Windows\System32 se encuentre o no el archivo cmd.exe?

¿No se encuentra?
Pide a alguien con la misma versión de windows xp te lo pase
Descarga el disco de windows xp de tu versión y encontraras un archivo que se llama cmd.ex_ lo que tienes que hacer es expanderlo en la carpeta C:\Windows\System32:

expand D:\cmd.ex_ C:\Windows\System32\cmd.exe

¿Si se encuentra?
Entonces ayudaria mucho que nos indicaras qué mensaje te aparece, porque pudiera aparecerte un mensaje que dice que fue deshabilitado por el administrador.
O tambien al ser un falso positivo el antivirus lo puso en cuarentena o evite su ejecución, por lo que ahí seria otra solución.

Si un AV te ha detectado como posible virus un archivo que se supone es legítimo de Windows (CMD.exe) entonces lo que has hecho no es una solución, añadir una regla de exclusión es empeorar las cosas.

Copia los archivos infectados desde una máquina virtual o desde el directorio WinSXS al directorio correspondiente (...\System32); ya se te ha dicho varias veces, no hay más que hablar.

Saludos