Hola, sí que existe un software para eso, tiene dos modos de instalarse, uno es en el pendrive para evitar que ningún virus del ordenador pase al pen.

Y  otro modo es instalarlo en el ordenador y evita que al pinchar un pen pueda pasar ningún virus al ordenador.

Yó lo he usado y es totalmente efectivo.

Te dejo el link a mi host para que lo descargues, MX ONE