Si lo estas leyendo a través de tu cliente ssh como pueda ser putty en windows o la consola directamente en Linux toda la información del buzón que estas obteniendo a través de esa sesión va cifrada de tal forma que cualquier interceptación de tu tráfico de red sería incomprensible. Ahora bien, si deseas descargar tu correo a tu PC local para tener una copia asegurare de usar el protocolo SCP que utiliza de nuevo un canal seguro para la transferencia. Una vez en tu disco cifralo con truecrypt o cualquier otra utilidad.

Un saludo