Si quieres distribuir el kernel modificado las instrucciones estan arriba.
Si lo que te refieres es al proceso de instalacion,debes inclluir los ficheros y meterlos en /etc/init.d y en /etc/init respectivamente, al igual qe se instalan las que vienen por defecto en una distribucion cualquiera.
haz un: ls -l /etc/init.d y  ls -l /etc/init    eso ficheros los introducen los que crean las distros. Yo no tocaria el kernel, perderas estabilidad.

El kernel crea el proceso init que se encarga de iniciar, ahi es donde tienes qe empezar a meter mano

Ya es he comentado como lo haria yo. kernel por defecto y aprovechar el upstart para arrancar desde alli el interprete cuando se inicie el OS.Si quereis seguir tirando por ahi por aqui estaré